Aili Paju (sündinud 8. septembril 1938 Tartus) on eesti arstiteadlane, Tartu Ülikooli professor, kirjanik.

Aili Paju sündis 8. septembril 1938 Tartus, esimesed eluaastad möödusid Tartumaal Sadalas. 1941. aasta kevadel kolis pere Kohtla-Järvele.
Ta õppis 1946-1957 Kohtla-Järve 1. Keskkoolis ning tegeles aktiivselt spordiga (Eesti noorte rekordiomanik odaviskes) ja muusikaga (orkestril hõbemedal vabariigi konkursilt). Aastatel 1957-1961 õppis Paju Tartu ülikooli arstiteaduskonna kehakultuuriosakonnas, omandas õpetaja kutse.
Aili Paju kuulus Eesti koondvõistkonna kergejõustikus ja võrkpallis, mängis rokkbändis "L´Organola" kitarri. Aastail 1961-1963 töötas Paju treenerina Kohtla-Järve Laste Spordikoolis. 1963-1968 õppis Tartu Ülikooli arstiteaduskonnas arst-terapeudiks. Aastatel 1967 kuni 1994 töötas Paju Tartu Ülikoolis. Alates 1994. aastast on ta vabakutseline kirjanik.
Kaitses meditsiinikandidaadi kraadi 1970. a. meditsiinidoktori kraadi 1975. a. ning oli Tartu ülikooli professor aastast 1979. Loengukursused ülikoolis: biokeemia, taastusravi, psühhosomaatika; rahvaülikoolis - loodusravi. Aili Paju organiseeris ja juhtis Maarjamõisa kliiniku ravikehakultuuri osakonda.
Aili Paju on mitme kodu- ja välismaise arstiteadusliku seltsi liige ning on olnud ka Eesti Spordimeditsiini Föderatsiooni president aastatel 1976-1980.